বরগুনা জেলায় বড় ধরণের কোন শিল্প বাণিজ্য কেন্দ্র নেই । তবে বাংলাদেশ মৎস্য উন্নয়ন করপোরেশনের অধীন পাথরঘাটা উপজেলা সদরে মৎস্য প্রক্রিয়াজাতকরণের জন্য মৎস্য অবতরণ ও বিক্রয় কেন্দ্র রয়েছে । এ ছাড়া রয়েছে ঃ-

খাদ্য প্রক্রিয়াজাত শিল্পঃ ২৫ টি

নদী উপকূলবর্তী শিল্প (লঞ্চ, ট্রলারের বডি তৈরী এবং মেরামত ) : ০২ টি।

রসায়ন শিল্প (আগরবাতি, মোমবাতি, কেশ তৈল, জর্দ্দা, ব্যাটারি এবং বাটার অয়েল তৈরী ) : জেলা সদরে ১০ টি

বস্ত্রজাত কুটির শিল্প (পোষাক তৈরী ) : জেলা সদরে ১০ টি।

কয়ার শিল্প (পাপোষ এবং বাঁশজাত দ্রব্য ):১০ টি।

বিবিধ শিল্প (সাইন বোর্ড,ব্যানার,স্বর্ণের গহণা ,রিং,স্লাব, পাইপ এবং ভেন্টিলেটর তৈরী ) : জেলা সদরে ১৯ টি এবং বিভিন্ন উপজেলায় ০৬ টি।